MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 6898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021082	A	7	7	1581920	1581926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021082	GGTT	2	8	1582319	1582326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021082	A	6	6	1582337	1582342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021082	TAC	2	6	1582364	1582369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_021082	TCAT	2	8	1590240	1590247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_021082	TTAG	2	8	1590263	1590270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021082	TGC	2	6	1590297	1590302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_021082	GTTT	2	8	1590315	1590322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021082	T	6	6	1590339	1590344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021082	CCT	2	6	1595979	1595984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_021082	AT	4	8	1595998	1596005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_021082	TTC	2	6	1596276	1596281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_021082	GCGA	2	8	1596298	1596305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_021082	GTTC	2	8	1596714	1596721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_021082	T	7	7	1596785	1596791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021082	ATT	2	6	1597456	1597461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021082	T	6	6	1599016	1599021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021082	ATA	2	6	1599025	1599030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021082	A	6	6	1599030	1599035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021082	CCT	2	6	1601043	1601048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_021082	A	6	6	1605388	1605393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021082	CAT	2	6	1605400	1605405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_021082	GAT	3	9	1605411	1605419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021082	A	6	6	1605432	1605437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021082	A	6	6	1605987	1605992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021082	CAA	2	6	1607533	1607538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_021082	A	6	6	1607537	1607542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021082	TGCACT	2	12	1607591	1607602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4030	NC_021082	TTG	2	6	1610299	1610304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021082	CCT	2	6	1613098	1613103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_021082	GGT	2	6	1613131	1613136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021082	AAATCA	2	12	1613410	1613421	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4034	NC_021082	ATA	2	6	1613456	1613461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021082	CTT	2	6	1615911	1615916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_021082	TTTA	2	8	1615922	1615929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021082	ATTTT	2	10	1615955	1615964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021082	ATA	2	6	1615995	1616000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021082	TAT	2	6	1616005	1616010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021082	ATTGTT	2	12	1616022	1616033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021082	ATA	2	6	1616051	1616056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021082	ACAA	2	8	1616070	1616077	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_021082	GA	3	6	1616408	1616413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021082	AAC	2	6	1616469	1616474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_021082	GGTT	2	8	1616513	1616520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021082	AC	3	6	1616578	1616583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_021082	AGTA	2	8	1616655	1616662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4049	NC_021082	GGGC	2	8	1616701	1616708	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_021082	TAT	2	6	1616744	1616749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021082	AAT	2	6	1616763	1616768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021082	GTT	2	6	1616816	1616821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_021082	AAC	2	6	1616832	1616837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_021082	TGA	2	6	1616887	1616892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_021082	TGT	2	6	1616972	1616977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4057	NC_021082	AATA	2	8	1617007	1617014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021082	AAAG	2	8	1617403	1617410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_021082	GT	3	6	1617439	1617444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_021082	T	7	7	1617503	1617509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021082	ATT	2	6	1618755	1618760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_021082	TTG	2	6	1619678	1619683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021082	TTA	2	6	1619695	1619700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4067	NC_021082	TAC	2	6	1621151	1621156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4069	NC_021082	T	6	6	1621188	1621193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021082	CT	3	6	1621236	1621241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_021082	AAAC	2	8	1621651	1621658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_021082	T	6	6	1621707	1621712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4080	NC_021082	ATACA	2	10	1622842	1622851	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4082	NC_021082	GCG	2	6	1623667	1623672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_021082	TGC	2	6	1623749	1623754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4086	NC_021082	A	6	6	1624920	1624925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021082	AATG	2	8	1625966	1625973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_021082	GA	3	6	1626532	1626537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_021082	T	6	6	1627855	1627860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_021082	TTA	2	6	1627922	1627927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021082	ATA	2	6	1627931	1627936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021082	TAA	2	6	1627941	1627946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021082	A	6	6	1627945	1627950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_021082	A	6	6	1629046	1629051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4098	NC_021082	TTA	2	6	1629186	1629191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4100	NC_021082	TAT	2	6	1630867	1630872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_021082	TA	3	6	1631352	1631357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_021082	ATAA	2	8	1631413	1631420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021082	A	7	7	1631419	1631425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021082	TCT	2	6	1631507	1631512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_021082	GGAA	2	8	1631532	1631539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021082	TTGG	2	8	1631577	1631584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021082	GAAA	2	8	1631595	1631602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_021082	GTA	2	6	1631613	1631618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021082	GGGT	2	8	1631642	1631649	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_021082	CCTT	2	8	1631669	1631676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_021082	ATTT	2	8	1631681	1631688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021082	TTAT	2	8	1631726	1631733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021082	ATT	2	6	1631778	1631783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_021082	ATT	2	6	1631852	1631857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_021082	TGA	2	6	1633337	1633342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021082	TGT	2	6	1633375	1633380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021082	TA	3	6	1633383	1633388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_021082	TCC	2	6	1633404	1633409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4120	NC_021082	ATT	2	6	1633455	1633460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021082	AATTTT	2	12	1633467	1633478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4123	NC_021082	TAC	2	6	1633483	1633488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4125	NC_021082	T	7	7	1636309	1636315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_021082	AGA	2	6	1637753	1637758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4128	NC_021082	TCT	2	6	1638908	1638913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_021082	GTT	2	6	1639642	1639647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_021082	GTT	2	6	1639652	1639657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_021082	GTT	2	6	1639693	1639698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_021082	TTTA	2	8	1639746	1639753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021082	ATAA	2	8	1639761	1639768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_021082	ATTT	2	8	1639808	1639815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_021082	GTT	2	6	1639824	1639829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4402	NC_021082	AATT	2	8	1722353	1722360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_021082	TCCG	2	8	1722378	1722385	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4404	NC_021082	T	7	7	1722414	1722420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_021082	CTTTT	2	10	1723355	1723364	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4406	NC_021082	TATT	2	8	1723368	1723375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4409	NC_021082	T	6	6	1726482	1726487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4410	NC_021082	TTTG	2	8	1728519	1728526	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4412	NC_021082	T	6	6	1728585	1728590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4413	NC_021082	AGA	2	6	1728626	1728631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4429	NC_021082	TTA	2	6	1737889	1737894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4432	NC_021082	AAT	2	6	1737983	1737988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4433	NC_021082	AAT	2	6	1738008	1738013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4434	NC_021082	ATT	2	6	1738015	1738020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4438	NC_021082	ATT	2	6	1738288	1738293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4439	NC_021082	T	6	6	1738292	1738297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4440	NC_021082	TATTT	2	10	1738303	1738312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4443	NC_021082	AT	3	6	1738340	1738345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4444	NC_021082	TA	3	6	1738372	1738377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4445	NC_021082	A	6	6	1738380	1738385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4450	NC_021082	CTTAC	2	10	1744091	1744100	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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